worker_intelligence_ner

工人智慧 命名實體識別

隱私保護與醫學數據標準化競賽：解碼臨床病例、讓數據說故事

TEAM_3970

公布競賽結果

分數

User	Rank	子任務 1：病患隱私資訊擷取	子任務 2：時間資訊正規化
zhaorui	3.00 (1)	0.8660 (5)	0.8685 (1)

Detailed Results

Coding Type	Precision	Recall	F-measure	Support
IDNUM	0.988775	0.9556604	0.9719357	2120
DOCTOR	0.9896409	0.8614367	0.9210992	3327
MEDICALRECORD	0.7879747	1	0.881416	747
PATIENT	0.9943899	0.9902235	0.9923022	716
DATE	0.9931213	0.9394063	0.9655173	2459
HOSPITAL	0.8809723	0.8772955	0.87913	1198
TIME	0.9954649	0.9340426	0.9637761	470
CITY	0.9942529	0.9276139	0.9597781	373
STREET	0.9855072	0.9883721	0.9869376	344
ZIP	1	0.9745042	0.9870875	353
STATE	1	0.9608434	0.9800308	332
DEPARTMENT	0.9280205	0.8615752	0.8935643	419
DURATION	0.8333333	0.8333333	0.8333333	12
AGE	0.9591837	0.9215686	0.9400001	51
ORGANIZATION	0.962963	0.7027027	0.8125001	74
URL	0	0	0	0
SET	0.8	0.8	0.8000001	5
LOCATION-OTHER	1	0.3333333	0.5	6
PHONE	1	1	1	1
Micro-avg. F	0.9627724	0.9205812	0.9412042	13007
Macro-avg. F	0.8996632	0.8348374	0.8660389	13007
-------------	----------:	:------:	----------:	----------:
-------------	----------:	:------:	----------:	----------:
Temporal Type	Precision	Recall	F-measure	Support
-------------	----------:	:------:	----------:	----------:
DATE	0.874026	0.8210655	0.8467184	2459
TIME	0.8542141	0.7978724	0.8250825	470
DURATION	1	0.8333333	0.9090909	12
SET	1	0.8	0.888889	5
Micro-avg.	0.8715165	0.8173795	0.8435803	2946
Macro-avg.	0.93206	0.8130678	0.8685071	2946
-------------	----------:	:------:	----------:	----------:

環境

• 作業系統：Windows 11 專業版 Insider Preview
• CPU：12th Gen Intel(R) Core(TM) i9-12900 2.40 GHz
• RAM : 32.0 GB
• 程式語言：Python 3.11.5
• 文字編輯器 : vscode 1.84.2

python 函式庫

• pandas 2.0.3

使用說明

比賽輸出

clone

git clone https://github.com/zhao-rui-NB/worker_intelligence_ner.git
cd worker_intelligence_ner

產生answer.txt

手動複製 opendid_test病例資料夾內容 到 worker_intelligence_ner\data\opendid_test

python main.py

可在.output取得answer.txt

小工具

file_open

自動以VSCODE開啟該病例

• -f 檔案編號
• -i 開始位置索引

python tool/file_open.py -f 1097 -i 438

ORGANIZATION 字典來源

dict V2 :

• https://www.50pros.com/fortune500
• https://www.sec.gov/files/rules/other/4-460list.htm