Utilisation des IA génératives comme appui à la programmation et au scripting pour la biologie

Information pratique et programme

• https://moodle.france-bioinformatique.fr/course/view.php?id=41
• https://ifb-elixirfr.github.io/AI-for-scripting-bioanalysis/

Organisation

Le colloque est organisé et financé par les trois organisations suivantes :

• Institut Français de Bioinformatique (IFB)
• Université Paris Cité (plateforme iPOP-UP et DU omiques)
• Réseau métier en bioinformatique (MERIT)

L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) a été fondé par les Programme d'Investissements d'Avenir subventionné par l'Agence Nationale de la Recherche (RENABI-IFB, ANR-11-INBS-0013) et par le programme France 2030 relatifs aux équipements structurants pour la recherche / EQUIPEX+ (MUDIS4LS, ANR-21-ESRE-0048).

Encadrants

• Imane Messak (Institut Français de Bioinformatique)
• Thomas Denecker (Institut Français de Bioinformatique)
• Baptiste Rousseau (Institut Français de Bioinformatique)

Atelier : Développement logiciel

Dans cet atelier, nous explorerons comment l’intelligence artificielle peut devenir un véritable assistant au service du développement logiciel. À l’aide d’outils comme Pleiade, chatGPT, Perplexity ou d’autres assistants basés sur l’IA, les participant·es apprendront à:

• Corriger automatiquement des erreurs dans leur code (syntaxe, logique, style)

• Optimiser des portions de code pour plus d'efficacité ou de lisibilité

• Suggérer des améliorations respectant les bonnes pratiques de programmation

• Passer avec succès les vérifications automatiques d'intégration continue (CI)

• Générer ou compléter automatiquement des fonctions, des tests unitaires ou de la documentation

Cet atelier a pour but de montrer comment l’IA peut accompagner les bioinformaticiens dans leurs projets de scripting et d’analyse, en réduisant le temps passé à déboguer et en augmentant la qualité du code produit.

Instruction pour l'atelier

1. Fork le project
2. Clone le projet
3. Ouvre le projet et commence a debuger avec ton outils IA préférer

À la fin de la session dans le README:

• ChatGPT
• ChatGPT based on GPT-4
• ~ 50 requêtes

Contributor Code of conduct

Veuillez noter que ce projet est publié avec Contributor Code of Conduct. En participant, vous acceptez d’en respecter les termes. Voir le fichier CODE_OF_CONDUCT.

Licence

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