这是我第一次使用 PyTorch 编写神经网络模型。项目目标是基于 GFP 序列预测其荧光亮度。
GFP_sequences.fasta:包含 GFP 蛋白质序列的 fasta 文件gfp_model1.pt:训练得到的 PyTorch 模型文件技术报告_碱基配对.ipynb:实验分析的 Jupyter Notebook.gitignore:Git 忽略配置文件
- ✅ 模型已完成初步搭建与训练
- 🧠 使用了双向 LSTM + 简单注意力机制
- 📉 目前模型拟合能力一般,预测效果还有待优化,对于主办方的排序需求实现不好
- 实现效果不如主办方的MLP
- 尝试改进模型结构(如加入卷积层或 transformer)
- 增加数据量,优化特征编码方式
- 添加更多评估指标,深入分析训练效果
- 进行模型可视化分析
本项目仅为学习用途,欢迎指正与建议 🙌