[GRDM-60339] CIの健全化

[yacchin1205]

CIを健全化するPRです。環境の経年変化に起因するテスト失敗を、upstream (jupyterhub/repo2docker) で解消済みの問題のcherry-pickおよびfork固有処理の修正により解消します。

1. chardet 6.x の非互換 (unit / venv / external の失敗)

2026年3月頃にリリースされた chardet 6.x で chardet.universaldetector という小文字モジュール経由のアクセスが廃止され、utils.py の open_guess_encoding が AttributeError で失敗するようになりました。

• jupyterhub/repo2docker@3f4296f6 fix import of universaldetector
• jupyterhub/repo2docker@847980b1 actually, let's avoid chardet altogether (chardet を charset-normalizer に置換)

後者は upstream では pyproject.toml の依存変更を含みますが、本forkは setup.py で依存を管理しているため、その部分のみ setup.py への変更として解決しています。なお、同趣旨のPRとして #24 がありましたが、upstreamコミットのcherry-pickで対応する方針としたため、本PRで置き換えます。

2. figshare のURL正規表現 (unit の失敗)

• jupyterhub/repo2docker@5edd0912 fix figshare url regex

3. DESCRIPTION型リポジトリのビルド失敗 (r の失敗)

DESCRIPTIONファイルを持つリポジトリのインストールは devtools::install_local(getwd()) で行われていますが、devtoolsは依存パッケージが多く、デフォルトのR (4.2.1) と最新のCRANスナップショットの組み合わせではPositのバイナリ提供が終了しているためソースビルドに落ち、依存の curl パッケージ等のビルド失敗によりdevtools自体がインストールされず、ビルドが失敗します(tests/r/r-rspm-description-file)。

upstreamは devtools::install_local の廃止(deprecated)対応としてこの経路を依存ゼロの remotes ベースに変更済みのため、該当コミットをcherry-pickします。

• jupyterhub/repo2docker@bcb46e14 Add --vanilla to R call
• jupyterhub/repo2docker@673e1bda Replace --vanilla with --no-init-file
• jupyterhub/repo2docker@066b12c8 R: install with pak
• jupyterhub/repo2docker@09cadb55 clear cache after pak install
• jupyterhub/repo2docker@37e5fbdb manually cleanup after pak
• jupyterhub/repo2docker@6882be5d remotes doesn't leave a mess (pakをやめてremotesに変更した最終形)

途中でpakを経由しているのはupstreamの試行の経緯をそのまま保持しているためで、最終状態は「基本インストールに remotes を追加し、DESCRIPTIONのインストールを remotes::install_local() で行う」となります。upstreamのCIでは同一のテストfixtureがこの構成でpassしています。

4. CS-rstudio-grdm インストールの GitHub API 依存の除去 (r の失敗・fork固有)

CS-rstudio-grdm のインストールに使用している remotes::install_github は api.github.com を無認証で参照するため、レートリミットによりビルドが確率的に失敗します(CIランナーの共有IPでは高頻度)。API を参照しない GitHub アーカイブ tarball からの取得 (remotes::install_url) に変更し、あわせてインストール結果の検証 (stopifnot) を追加してインストール失敗が確実にビルドエラーとして顕在化するようにしました。これは #25 で remotes::install_github 化した処理の改善です。

動作確認

• ローカルで tests/unit/test_utils.py 37件、tests/unit/contentproviders/test_figshare.py 14件、tests/unit/test_r.py 9件のパスを確認済み
• tests/r/r-rspm-description-file に対する生成Dockerfileが upstream と同一のインストールコマンドになることを確認済み
• CS-rstudio-grdm の tarball インストールについては、ローカルDocker環境で remotes のブートストラップ→依存解決 (jsonlite)→rdmaddins のインストールまでを実行し、RStudio の Addins メニューに「Sync to RDM」が表示される(Addinが有効化される)ことをブラウザ上で確認済み

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