test-data: acquire D1 corpus fixture

[lipluscodex]

Closes #7
本番 D1 の search_docs / doc_edges から、read-only invariant と schema fingerprint を検証して決定論的 fixture / provenance を生成する取得経路を追加します。
実データ fixture で ingest、時系列 metadata、graph activation、success feedback を統合検証し、#178 backfill 後の coverage 比較手順も機械化します。

[lipluscodex]

AI self-review

実装差分は PASS。merge gate は github-rag-mcp#178 の backfill / coverage 再比較待ち。

Acceptance criteria

• 本番 D1 取得を単一 SELECT / WITH に制限し、全 query の rows_written=0 / changes=0 / changed_db=false を検証: PASS
• live search_docs / doc_edges schema fingerprint と変換契約の固定: PASS
• 決定論的な小 fixture、provenance、欠損 endpoint 集計、credential-like文字列の最終payload全体でのredaction: PASS
• 実fixtureによる ingest / search / time metadata / graph activation / success feedback: PASS
• coverage比較tool、取得・完全性限界・再取得手順の文書化: PASS
• #178 backfill後の再取得とcoverage比較: PENDING（2026-08-01時点で対象gap scanは0件、#178は waiting）

Review findings resolved

• 空文字 commit_sha がnon-diff surfaceでdistinct commit 1件として数えられる問題を NULLIF と回帰テストで修正。
• source引数 / known gap からfixture・provenanceへcredential-like文字列が入る経路を最終payload redactionと回帰テストで修正。

Verification

• Local: 21/21 tests PASS、eval PASS
• Production recapture: committed fixtureとbyte-identical、zero-write、redactions 0
• GitHub CI: PASS
• PR merge state: CLEAN

Scope deviation: なし。

Next step: #178 backfill完了後に同一引数で再取得し、coverage差分を確認してfixture / provenanceを必要に応じて更新、CI greenを再確認してからmergeする。

[lipluscodex]

AI self-review (final)

更新後の commit ff221b8 を issue #7 の acceptance criteria、PR diff、production evidence、CI に対して再確認し、PASS と判定した。

Acceptance criteria

• 本番 D1 の search_docs / doc_edges を schema fingerprint 付きで read-only 取得し、各 query の rows_written=0 / changes=0 / changed_db=false を検証: PASS
• 決定論的 fixture、provenance、欠損 endpoint 集計、最終 payload 全体の credential redaction: PASS
• 実 fixture による ingest / search / time metadata / graph activation / success feedback: PASS
• backfill 後の再取得と coverage 監査: PASS
  • 欠損窓 2026-07-08..07-22: 0 rows / 0 commits -> 4 rows / 2 commits
  • GitHub patched files と D1 rows: 4 / 4
  • 2026-07-06..HEAD: GitHub 36 commits / D1 36 commits
  • 最新 c1504a9 を D1 / MCP で確認
  • global provenance は 1318 rows / 494 commits のまま（初回 backfill 後の取得済み snapshot だったため）
• known_gaps は未解消 gap のみ、解消済みなら空配列という契約を requirements / docs / tests / committed provenance で一致: PASS

Review finding resolved

取得例が解消済み #178 を --known-gap に残していた矛盾を ff221b8 で修正し、未解消 gap がある場合のみ指定する例へ揃えた。

Verification

• Local: 21/21 tests PASS
• Eval smoke: PASS (graph MRR 0.5, baseline 0.361111; improved queries 2/3)
• GitHub CI run 30700483524: SUCCESS
• Merge state: CLEAN
• Diff check / worktree: clean

Scope deviation: なし。

Review partition:

• now: blocker なし
• later: github-rag-mcp #178 の tracker state は open のままだが、production data gate は実測で満了しており本 PR の merge blocker ではない
• accepted: D1 は検索用の損失あり snapshot であり、byte-exact history の正本は GitHub とする

Next step: squash mergeし、Closes #7 により issue を自動 close する。