eval: compare neural dynamics on frozen holdout

[lipluscodex]

Closes #11

結果観測前に固定した development / holdout と13 variantsを再現可能に比較し、全候補、diagnostics、Pareto選択を保存します。
holdoutを一度だけ開封した結果、選択候補はrelation退行で不採用とし、既定strategyを変更せず全tradeoffを記録します。

[lipluscodex]

自己レビュー: PASS（ブロッカーなし）

受入確認:

• protocol freeze commit 4f240dd に manifest、13 variants、development/holdout 分離、選択規則、停止規則、D1 holdout/gold/provenance、実行系とテストが入り、result JSON は未存在だったことを確認。
• freeze から head まで manifest、holdout fixture、gold、provenance は不変。結果コミットの limit 参照修正は凍結値 12 と9-node fixtureのため観測値に影響せず、head からの再生成で development/holdout JSON がともにバイト一致。
• development では5候補が gate 通過し、固定 tie-break で budget-025 を選択。全13 variants と失敗/tradeoff を保存。
• holdout は current と選択候補のみを一度評価。relation MRR 0.3611 -> 0.3254 の退行により固定 stop rule で不採用。
• EngineConfig.activation_strategy の既定は current_positive_additive のまま。path 3/3、feedback isolation、D1 zero-write provenance を確認。
• ローカル 34 tests PASS、GitHub CI SUCCESS、worktree clean。

判定区分:

• 今回: マージ可。実験の陰性結果を含め、Issue #11 の検証目的を満たす。
• 残存リスク: fixture は固定 Li+ wiki subset と feature-hashing encoder に限定され、一般 corpus や別 graph topology への一般化は未確認。
• 受容したトレードオフ: development winner は未見 holdout に一般化しなかったため、既定実装を変えず、失敗結果を再利用可能な artifact として残す。