-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
Expand file tree
/
Copy pathScribe.py
More file actions
41 lines (27 loc) · 1.87 KB
/
Copy pathScribe.py
File metadata and controls
41 lines (27 loc) · 1.87 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
#!/usr/bin/env python
#-*- coding:utf8 -*-
"""
Auteur : HENRIQUES Adrien et ARBES Hugo
date : 28/04/2017
Programme Scribe : Permet d'ecrire les differents dictionnaires dans des fichiers de sortie.
"""
import os
def ScribeGlobal(dicoRMSDglob,dico_giration):
""" ouvre un fichier de sortie et ecrit dedant les informations selectionnées a propos de la RMSD globale et angle de giration """
sortieGlobale= open("Out_Global.txt",'w') # Ouverture d'un fichier de sortie en mode ecriture
donnees ="ConformationRef\tConformationTmps\tRMSD\tAngleGiration\n" # 1er ligne qui sera dans le fichier de sortie
for prot1 in sorted(dicoRMSDglob.keys()): # Parcourt des conformations du dictionnaire de RMSD globale
nom_prot = str(prot1)
for prot2 in sorted(dicoRMSDglob[prot1].keys()): # Parcourt de proteine referente du dictionnaire de RMSD globale
donnees += str(prot2)+"\t\t\t"+str(prot1)+"\t\t"+str(round(dicoRMSDglob[prot1][prot2],3))+"\t"+str(round(dico_giration[prot1],3))+"\n" #Ce qu'on va ecrire a chaque ligne
sortieGlobale.write(donnees) # Ecriture dans le fichier de sortie
sortieGlobale.close() # Fermeture du fichier de sortie
def ScribeLocal(dicoRMSDloc,dico_distances):
"""Ouvre un fichier de sortie et ecrit les informations retenue dans la RMSD locale et angle de giration """
sortieLocale= open("Out_local.txt",'w')
donneesloc ="Position\tRMSD\tDistanceCentre\n"
for chaine in dicoRMSDloc.keys(): # On parcourt les differentes proteines de reference du dictionnaire de RMSDlocale
for position in sorted(dicoRMSDloc[chaine].keys()): # On parcourt son 2eme niveau de dictionnaire correspondant aux positions differentes
donneesloc += str(position)+"\t\t"+str(round(dicoRMSDloc[chaine][position],3))+"\t"+str(round(dico_distances[chaine][position]))+"\n"
sortieLocale.write(donneesloc)
sortieLocale.close()